Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1a4Q9WV27 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1a4Q9WV27 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1a4Q9WV27 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1a4Q9WV27 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1a4Q9WV27 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1a4Q9WV27 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1a4Q9WV27 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1a4Q9WV27 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1a4Q9WV27 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1a4Q9WV27 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1a4Q9WV27 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1a4Q9WV27 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1a4Q9WV27 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1a4Q9WV27 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1a4Q9WV27 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1a4Q9WV27 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1a4Q9WV27 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1a4Q9WV27 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp1a4Q9WV27 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp1a4Q9WV27 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms