Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamc3Q9R0B6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamc3Q9R0B6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms