Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rnf4Q9QZS2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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