Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp21Q9QZL6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp21Q9QZL6 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp21Q9QZL6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp21Q9QZL6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp21Q9QZL6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp21Q9QZL6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Usp21Q9QZL6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Usp21Q9QZL6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Usp21Q9QZL6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Usp21Q9QZL6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms