Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Trpc3Q9QZC1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Trpc3Q9QZC1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trpc3Q9QZC1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trpc3Q9QZC1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trpc3Q9QZC1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Trpc3Q9QZC1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trpc3Q9QZC1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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