Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

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Length 761 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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