Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snai3Q9QY31 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms