Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChmQ9QXG2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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