Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trim44Q9QXA7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trim44Q9QXA7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms