Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trpc5Q9QX29 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms