Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dkk3Q9QUN9 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms