Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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SrfQ9JM73 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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SrfQ9JM73 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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SrfQ9JM73 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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SrfQ9JM73 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SrfQ9JM73 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SrfQ9JM73 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SrfQ9JM73 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SrfQ9JM73 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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