Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Rabgef1Q9JM13 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms