Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms