Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tlr5Q9JLF7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tlr5Q9JLF7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tlr5Q9JLF7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tlr5Q9JLF7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tlr5Q9JLF7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tlr5Q9JLF7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tlr5Q9JLF7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tlr5Q9JLF7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Tlr5Q9JLF7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms