Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms