Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc28a3Q9ERH8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms