Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfcp2Q9ERA0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms