Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Tspan4Q9DCK3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Tspan4Q9DCK3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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