Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Prr13-202ENSMUST00000164688 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Gm43693-201ENSMUST00000196072 1249 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Gm30655-201ENSMUST00000220498 1383 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Gm43805-201ENSMUST00000198488 824 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 AC166902.3-201ENSMUST00000216696 991 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Riok3Q9DBU3 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms