Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Smg9Q9DB90 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Smg9Q9DB90 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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