Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med27Q9DB40 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med27Q9DB40 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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