Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy3Q9DAU1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy3Q9DAU1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy3Q9DAU1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy3Q9DAU1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy3Q9DAU1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy3Q9DAU1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy3Q9DAU1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy3Q9DAU1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy3Q9DAU1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy3Q9DAU1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy3Q9DAU1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy3Q9DAU1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy3Q9DAU1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnpy3Q9DAU1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cnpy3Q9DAU1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cnpy3Q9DAU1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cnpy3Q9DAU1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cnpy3Q9DAU1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnpy3Q9DAU1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms