Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms