Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Tmem239Q9DA47 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Tmem239Q9DA47 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Tmem239Q9DA47 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem239Q9DA47 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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