Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms