Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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