Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cnot8Q9D8X5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cnot8Q9D8X5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot8Q9D8X5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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