Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D8N1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms