Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slx4ipQ9D7Y9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms