Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp4cQ9D7F7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms