Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D7E4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D7E4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms