Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Srp19Q9D7A6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Srp19Q9D7A6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Srp19Q9D7A6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Srp19Q9D7A6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Srp19Q9D7A6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Srp19Q9D7A6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Srp19Q9D7A6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srp19Q9D7A6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srp19Q9D7A6 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Srp19Q9D7A6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Srp19Q9D7A6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srp19Q9D7A6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srp19Q9D7A6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Srp19Q9D7A6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp19Q9D7A6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp19Q9D7A6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp19Q9D7A6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp19Q9D7A6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp19Q9D7A6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp19Q9D7A6 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp19Q9D7A6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp19Q9D7A6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp19Q9D7A6 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp19Q9D7A6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp19Q9D7A6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp19Q9D7A6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Srp19Q9D7A6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms