Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc94Q9D6J3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms