Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ccdc7Q9D541 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ccdc7Q9D541 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ccdc7Q9D541 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7Q9D541 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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