Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PrameQ9D4Z5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PrameQ9D4Z5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PrameQ9D4Z5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PrameQ9D4Z5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PrameQ9D4Z5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrameQ9D4Z5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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