Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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