Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Snx29Q9D3S3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Snx29Q9D3S3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Snx29Q9D3S3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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