Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms