Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms