Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf146Q9CZW6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf146Q9CZW6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf146Q9CZW6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf146Q9CZW6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf146Q9CZW6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf146Q9CZW6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf146Q9CZW6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms