Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChtopQ9CY57 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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