Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkrip1Q9CWV6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkrip1Q9CWV6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prkrip1Q9CWV6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prkrip1Q9CWV6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prkrip1Q9CWV6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prkrip1Q9CWV6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms