Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Khdc3Q9CWU5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms