Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms