Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms