Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Fcf1Q9CTH6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Fcf1Q9CTH6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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