Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms