Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms