Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms